35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17936 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  100 
 
 
206 aa  427  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  46.77 
 
 
203 aa  175  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  38.38 
 
 
200 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80500  protein involved in endosome to golgi protein transport  31.45 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205498 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  29.88 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.81 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.05 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  29.63 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  38.89 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  26.95 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.68 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.48 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.36 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.47 
 
 
162 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.08 
 
 
166 aa  48.5  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.13 
 
 
186 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.17 
 
 
179 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.09 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.22 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30.22 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.45 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  34.26 
 
 
154 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  30.07 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.66 
 
 
186 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  27.21 
 
 
178 aa  45.1  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  25.17 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.62 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.65 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.51 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  26.53 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  27.86 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.29 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>