151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1784 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  42.42 
 
 
197 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  39.44 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  51.67 
 
 
158 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  31.63 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  35.19 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  30.28 
 
 
312 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  36.61 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  35.19 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  33.86 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  36.54 
 
 
133 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  29 
 
 
245 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  44.64 
 
 
164 aa  54.7  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  29.31 
 
 
325 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  37.89 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  27.88 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  27.43 
 
 
312 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  33.65 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  27.66 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  27.66 
 
 
251 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  31.25 
 
 
321 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  29.67 
 
 
325 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  34.62 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  28.21 
 
 
304 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  28.46 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  27.88 
 
 
288 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  52.38 
 
 
176 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  45.16 
 
 
161 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  32.63 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  26.89 
 
 
321 aa  51.2  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  32.22 
 
 
506 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  29.67 
 
 
295 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  26.92 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  31.43 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  28.57 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  29.67 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  27.96 
 
 
314 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  33.71 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  44.23 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  30.77 
 
 
327 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  25.23 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  29.51 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  39.71 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  29.76 
 
 
323 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.46 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  31 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  22.48 
 
 
340 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  27.45 
 
 
321 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  28.57 
 
 
335 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  29.67 
 
 
319 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  46.94 
 
 
76 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  30.28 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  32.98 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  29.67 
 
 
321 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  29.03 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  29.67 
 
 
321 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  26.95 
 
 
152 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  27.27 
 
 
338 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.03 
 
 
236 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  30 
 
 
287 aa  48.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 
336 aa  48.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  24.49 
 
 
326 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  26.92 
 
 
282 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  24.64 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  28.71 
 
 
250 aa  47.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.22 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  24.32 
 
 
323 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  24.03 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  41.79 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  26.88 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  26.88 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  21.67 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  24.24 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  27.78 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
321 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  28.24 
 
 
153 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  29.13 
 
 
288 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  28.57 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  29.55 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  24.11 
 
 
323 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
179 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>