More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0042 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  54.81 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  52.59 
 
 		 280 aa  304  9.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  54.21 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  52.22 
 
 		 280 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  54.81 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  53.18 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  53.82 
 
 		 283 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.35 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  54.2 
 
 		 279 aa  284  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  50.56 
 
 		 280 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  51.32 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  270  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.76 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  47.97 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  48.51 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.23 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.53 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  48.68 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.61 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  44.75 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  52.29 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 276 aa  254  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.75 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.99 
 
 		 526 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.15 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  48.05 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.56 
 
 		 511 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.88 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.18 
 
 		 511 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.97 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.01 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  46.12 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.9 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.63 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.9 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47.94 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.91 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.91 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  46.47 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  43.91 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  43.61 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.44 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  43.54 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  42.18 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  46.42 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>