More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_817 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  95.71 
 
 		 630 aa  1231    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  93.33 
 
 		 630 aa  1205    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  100 
 
 		 630 aa  1294    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  48.08 
 
 		 633 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  45.53 
 
 		 649 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 		 647 aa  582  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  41.83 
 
 		 651 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  39.87 
 
 		 646 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 631 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 		 650 aa  485  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 652 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 643 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 650 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 655 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 643 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 655 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  36.26 
 
 		 656 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 654 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 654 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.32 
 
 		 642 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 661 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 642 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 643 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 651 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 644 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 682 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 654 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  36.64 
 
 		 656 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 648 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 653 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 653 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 659 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 661 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 648 aa  412  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 607 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 648 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 657 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 636 aa  389  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 634 aa  389  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 611 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 618 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 626 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 601 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 596 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 594 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 633 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 617 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 		 603 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 603 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 622 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 610 aa  253  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 603 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 612 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.17 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.64 
 
 		 601 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 597 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 605 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.01 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 649 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 598 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 607 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 612 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 598 aa  237  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  27.53 
 
 		 602 aa  236  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.87 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 616 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 599 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 604 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 602 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 604 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 635 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 635 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 635 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 612 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>