More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4693 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  100 
 
 		 561 aa  1150    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  51.21 
 
 		 582 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  43.67 
 
 		 562 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  44.04 
 
 		 560 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  42.17 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.27 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 858 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.96 
 
 		 925 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 827 aa  193  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  32.68 
 
 		 925 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  32.74 
 
 		 910 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  33.24 
 
 		 917 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  32.74 
 
 		 910 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  31.43 
 
 		 835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.24 
 
 		 917 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 977 aa  183  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  26.7 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 916 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 922 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 956 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 1159 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 917 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 919 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 917 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 1046 aa  177  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 889 aa  177  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  32.77 
 
 		 1392 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1155 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1155 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1203 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 778 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 818 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 1145 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 930 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 917 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 		 1162 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  29.15 
 
 		 800 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00470  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.38 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1155 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1163 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  32.51 
 
 		 905 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 916 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 818 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 909 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.09 
 
 		 833 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.46 
 
 		 998 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 791 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  39.37 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1303 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 775 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  40.57 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 1137 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.11 
 
 		 1361 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  34.52 
 
 		 1200 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 763 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 1143 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  34.8 
 
 		 1196 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1362 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 631 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  39.75 
 
 		 461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 678 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.75 
 
 		 461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.43 
 
 		 906 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1149 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  30.95 
 
 		 651 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 2010 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1195 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1155 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 896 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1158 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1214 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  39.45 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 		 896 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  31.74 
 
 		 896 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 628 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1297 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 641 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  38.95 
 
 		 1137 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  29.03 
 
 		 629 aa  165  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 		 896 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 		 896 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  37.76 
 
 		 1161 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  31.2 
 
 		 896 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  33.44 
 
 		 1170 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 699 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 		 1158 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  31.74 
 
 		 896 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1194 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1011 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>