271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4000 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  53.14 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  39.16 
 
 
194 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
195 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
178 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
176 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
195 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.75 
 
 
183 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.57 
 
 
182 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.88 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  33.71 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  30.59 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.29 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  35.09 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  32.95 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.93 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.79 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.65 
 
 
181 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  36.26 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.37 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  32.37 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.81 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.21 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.64 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.64 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  30.64 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  31.98 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.41 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  28.32 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.95 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.2 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.67 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.85 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.85 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.96 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.22 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.61 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  28.98 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.96 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  25.95 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.97 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.49 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  28.02 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  30.51 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.22 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  31.5 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.21 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  26.49 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  24.31 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.2 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  31.71 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.49 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.68 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.96 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.34 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  23.76 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>