More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3881 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  47.78 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  46.78 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  43.41 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  40.85 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  42.86 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  41.24 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  46.51 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.61 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  39.8 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.61 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.61 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  38.86 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  37.02 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  38.42 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  37.56 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.06 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  38.3 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  38.3 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  33.65 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.06 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  38.89 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  37.44 
 
 		 607 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  35.38 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  38.12 
 
 		 804 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  35.2 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  32.38 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.41 
 
 		 839 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  34.31 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  37.3 
 
 		 800 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  32.6 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  35.38 
 
 		 804 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  34.57 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  34.78 
 
 		 780 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.39 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  34.04 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  34.42 
 
 		 1132 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  33.65 
 
 		 1132 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  36.11 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  33.18 
 
 		 1132 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  34.33 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.99 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.95 
 
 		 1132 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  33.65 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  32.99 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  32.98 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  36.9 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.28 
 
 		 326 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.96 
 
 		 1132 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  29.63 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  33.15 
 
 		 793 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  33.86 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  33.86 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  36.36 
 
 		 806 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  34.38 
 
 		 801 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.16 
 
 		 774 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  33.51 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  32.18 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.76 
 
 		 841 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  31.58 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  34.24 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  35.03 
 
 		 804 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  36.46 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.41 
 
 		 818 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  32.45 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  34.39 
 
 		 801 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  34.22 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  33 
 
 		 807 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  32.4 
 
 		 819 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  35.8 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  32.8 
 
 		 804 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  32.11 
 
 		 811 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  34.57 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  32.46 
 
 		 804 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 		 813 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.83 
 
 		 802 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.6 
 
 		 781 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  31.94 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  30.66 
 
 		 1136 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  33.16 
 
 		 841 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  31.58 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  32.53 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  33.75 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  29.67 
 
 		 1136 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.85 
 
 		 804 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  31.37 
 
 		 556 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  33.15 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.16 
 
 		 1169 aa  94.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>