More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0621 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  100 
 
 		 363 aa  703    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  96.69 
 
 		 363 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  94.44 
 
 		 334 aa  524  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  94.44 
 
 		 334 aa  524  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  47.54 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  46.2 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  43.62 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  43.03 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  43.12 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  46.39 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  43.64 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  52.8 
 
 		 338 aa  259  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  47.52 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  49.82 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  43.67 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  41.41 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  45.04 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.73 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  44.6 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  45.48 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  45.71 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  40.56 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.78 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  49.65 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  38.84 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  42.46 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  45.08 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  47.64 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.61 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  39.43 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  44.14 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  45.94 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  41.12 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  49.65 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  44.56 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  39.77 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  47.74 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  45.24 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.81 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  44.48 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  45.04 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  42.55 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  43.43 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.77 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.44 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.93 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  42.11 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  42.46 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  44.03 
 
 		 353 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  43.66 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  39.86 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.86 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  37.43 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  43.62 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  48.99 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.63 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.8 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  42.37 
 
 		 452 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  40.33 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  41.62 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  44.75 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  44.56 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  43.67 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  38.38 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  43.67 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  43.67 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.64 
 
 		 336 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.94 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  42.77 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  39.94 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  46.01 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  42.41 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.89 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  41.18 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  40.61 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  42.37 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  41.16 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  36.89 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  46.69 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  44.68 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  42.76 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.57 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  40.94 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  38.79 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  41.54 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 		 359 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  43.88 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  40.4 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.88 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  44.01 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.22 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  42.9 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  37.89 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  44.51 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  42.25 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  43.97 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  42.76 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>