More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3314 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
236 aa  483  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
224 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
224 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 
224 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  42.13 
 
 
227 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
216 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  41.5 
 
 
236 aa  132  4e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 
232 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
218 aa  117  1e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
226 aa  114  1e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.81 
 
 
222 aa  112  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
232 aa  112  4e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 
219 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
222 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
226 aa  111  8e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 
231 aa  110  1e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
224 aa  110  1e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 
224 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  34.12 
 
 
249 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 
232 aa  108  9e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  34.13 
 
 
221 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
233 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
194 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
232 aa  75.9  5e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  29.95 
 
 
227 aa  74.7  1e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
202 aa  74.3  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
217 aa  74.3  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
242 aa  74.3  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 
223 aa  73.6  2e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  32.43 
 
 
235 aa  72.8  4e-12  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 
225 aa  72.8  5e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
229 aa  71.6  9e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.35 
 
 
222 aa  71.2  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
241 aa  71.2  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
232 aa  71.2  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 
231 aa  71.2  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
240 aa  71.2  1e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
234 aa  70.5  2e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
241 aa  70.1  3e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17475e-07 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
242 aa  70.1  3e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 
223 aa  70.1  3e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
237 aa  68.6  8e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 
233 aa  67.8  1e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 
231 aa  67.8  1e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 
245 aa  67.8  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
239 aa  65.5  6e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
232 aa  65.5  6e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 
219 aa  65.5  7e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
231 aa  65.1  9e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.18605e-05  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 
222 aa  65.1  9e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  40.54 
 
 
229 aa  65.1  9e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  28.06 
 
 
207 aa  65.1  9e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
244 aa  65.1  9e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  9.51338e-07 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
219 aa  64.7  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
396 aa  64.7  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
257 aa  64.3  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  32.35 
 
 
227 aa  64.3  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 
238 aa  63.5  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
229 aa  64.3  2e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
275 aa  64.3  2e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 
243 aa  63.9  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
206 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 
260 aa  63.5  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
253 aa  63.2  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
229 aa  63.2  4e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
247 aa  62.8  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 
269 aa  63.2  4e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
229 aa  62.8  4e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 
236 aa  62.4  5e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
235 aa  62.8  5e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
267 aa  62.4  6e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 
227 aa  62.4  7e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 
209 aa  62  7e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
232 aa  62  7e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 
219 aa  62  7e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 
212 aa  62  7e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
232 aa  62  8e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
235 aa  62  8e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 
218 aa  62  8e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  35.95 
 
 
242 aa  62  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
239 aa  61.2  1e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
225 aa  61.6  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 
258 aa  61.6  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
252 aa  61.2  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
224 aa  61.6  1e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  42.53 
 
 
236 aa  61.6  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
223 aa  61.6  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.73195e-08  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
229 aa  61.2  1e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
216 aa  60.5  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  39.56 
 
 
226 aa  60.8  2e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
242 aa  60.8  2e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>