More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0582 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.91 
 
 		 237 aa  364  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  75.65 
 
 		 234 aa  355  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  75.65 
 
 		 236 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  70 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  67.97 
 
 		 236 aa  312  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.65 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  67.53 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  67.53 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.04 
 
 		 232 aa  296  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  62.61 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  62.61 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.2 
 
 		 235 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.2 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.2 
 
 		 235 aa  294  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 232 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  61.74 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  51.11 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  53.37 
 
 		 234 aa  227  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  48.54 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  47 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.76 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  51.76 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  47.22 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 258 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  51.46 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  49.11 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  44.74 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.59 
 
 		 377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 368 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  46.67 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.47 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 		 384 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 360 aa  161  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 		 382 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.71 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.26 
 
 		 384 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.26 
 
 		 384 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 		 378 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 378 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 379 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 		 388 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 330 aa  158  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  41.63 
 
 		 328 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 		 384 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  41.67 
 
 		 350 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 		 381 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 408 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.74 
 
 		 372 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.72 
 
 		 400 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 		 372 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.85 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  38.53 
 
 		 334 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  38.7 
 
 		 334 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.17 
 
 		 426 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.64 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.38 
 
 		 373 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 381 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 377 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 377 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 377 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.72 
 
 		 377 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 357 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 378 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  38.81 
 
 		 368 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.49 
 
 		 348 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  41.26 
 
 		 387 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  39.74 
 
 		 365 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 377 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>