More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2179 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 467 aa  912    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  71.23 
 
 		 356 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  66.07 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  64.85 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  65.36 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  64.96 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  68.39 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  68.17 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  60.4 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.97 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  66.97 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  66.97 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  63.9 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  68.18 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  68.18 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  57.95 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  63.43 
 
 		 357 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  59.15 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  59.34 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  58.73 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  57.75 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  56.85 
 
 		 352 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  57.34 
 
 		 357 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  57.06 
 
 		 358 aa  359  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  56.1 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  56.1 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  56.1 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  56.1 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  55.81 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  56.21 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.93 
 
 		 355 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  56.1 
 
 		 355 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  56 
 
 		 355 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  55.93 
 
 		 355 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.93 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  55.93 
 
 		 355 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  55.93 
 
 		 355 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  56.9 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  56.71 
 
 		 355 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  56.63 
 
 		 358 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  58.08 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  55.97 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  51.94 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  56.63 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  53.71 
 
 		 355 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  53.71 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  49.85 
 
 		 350 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  53.22 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 365 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  45.07 
 
 		 332 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  71.7 
 
 		 161 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 351 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  45.07 
 
 		 343 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  44.3 
 
 		 331 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  43.6 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  41.53 
 
 		 346 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  43.29 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  43.29 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  43.29 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 348 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  41.33 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  40 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  41.85 
 
 		 321 aa  216  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  43.2 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  38.16 
 
 		 334 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  38.67 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 332 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  39.01 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  39.01 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  42.02 
 
 		 319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  36.9 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  62.69 
 
 		 195 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 332 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  47.85 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  31.29 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.97 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  30.53 
 
 		 332 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.21 
 
 		 329 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  31.07 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.21 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.21 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 		 425 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.84 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.52 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  29.84 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  28.74 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 333 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  27.72 
 
 		 311 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>