More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1923 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  82.33 
 
 		 236 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  82.33 
 
 		 236 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  82.33 
 
 		 236 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  81.9 
 
 		 236 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  81.47 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  81.03 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  80.52 
 
 		 245 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  80.43 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  80.7 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  80.17 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  79.22 
 
 		 236 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  78.35 
 
 		 243 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  76.72 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  77.68 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  81.82 
 
 		 244 aa  370  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  79.22 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  78.45 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  78.45 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  74.67 
 
 		 243 aa  362  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  80.35 
 
 		 235 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  75.76 
 
 		 235 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  46.79 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  45.96 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  54.34 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  46.64 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  45.53 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  46.19 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  79.17 
 
 		 122 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  48.88 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.66 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.54 
 
 		 644 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.27 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.01 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.17 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.78 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  40.53 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.69 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.73 
 
 		 663 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  44.14 
 
 		 652 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  42.29 
 
 		 663 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  42.15 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  42.33 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  42.15 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  42.15 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40.72 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  42.53 
 
 		 657 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.15 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  42.54 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  40.77 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  37.44 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.09 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 328 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  40.99 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  40.99 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  42.15 
 
 		 276 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.45 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  43.18 
 
 		 287 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  44.14 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  41.89 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.18 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.91 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>