More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0021 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  59.12 
 
 
298 aa  351  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  60.89 
 
 
279 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  54.92 
 
 
277 aa  298  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  52.94 
 
 
286 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  54.55 
 
 
284 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  51.69 
 
 
281 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  53.56 
 
 
269 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  52.27 
 
 
273 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  52.27 
 
 
273 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  51.52 
 
 
273 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  51.12 
 
 
279 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  51.52 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  51.7 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
280 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  51.89 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
279 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  50.18 
 
 
277 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  51.33 
 
 
303 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  50 
 
 
285 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  48.7 
 
 
276 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  49.26 
 
 
277 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  52.63 
 
 
274 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
269 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  49.26 
 
 
277 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  47.76 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  48.48 
 
 
285 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  48.69 
 
 
279 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
275 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  47.73 
 
 
285 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.11 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  47.73 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.73 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  47.35 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  51.32 
 
 
282 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  50.19 
 
 
281 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  47.41 
 
 
284 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  47.31 
 
 
273 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
269 aa  260  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
280 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  49.25 
 
 
286 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  49.06 
 
 
281 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  46.99 
 
 
269 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  46.21 
 
 
274 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  46.12 
 
 
277 aa  244  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  48.02 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  46.44 
 
 
269 aa  241  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  45.35 
 
 
274 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.7 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  46.27 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  44.9 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 
271 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.62 
 
 
565 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 
369 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  32.21 
 
 
980 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.45 
 
 
1242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
1279 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.71 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.46 
 
 
1158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.83 
 
 
993 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.72 
 
 
1010 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
256 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.45 
 
 
1348 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.48 
 
 
1371 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  30.11 
 
 
1618 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.1 
 
 
1361 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.61 
 
 
1384 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  32.51 
 
 
1006 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  34.09 
 
 
1149 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.65 
 
 
1000 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  31.54 
 
 
1027 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  31.93 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.66 
 
 
1008 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.59 
 
 
617 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  30.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.73 
 
 
1378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  32.58 
 
 
1170 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
1170 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
852 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.01 
 
 
887 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  29.74 
 
 
1483 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.11 
 
 
1380 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.64 
 
 
1404 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  33.05 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.22 
 
 
1215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
856 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.21 
 
 
1445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  31.52 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  32.8 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 
1008 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.15 
 
 
1407 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0713  MCP methyltransferase, CheR-type  31.93 
 
 
256 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.89 
 
 
1218 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.39 
 
 
971 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  32.33 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.02 
 
 
1167 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>