More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2863 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.49 
 
 		 611 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.94 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.77 
 
 		 590 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 		 596 aa  666    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.77 
 
 		 591 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.07 
 
 		 592 aa  853    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.52 
 
 		 591 aa  681    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.92 
 
 		 592 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.94 
 
 		 591 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.9 
 
 		 587 aa  685    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1902  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.6 
 
 		 613 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.43 
 
 		 591 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.77 
 
 		 590 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.55 
 
 		 589 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.55 
 
 		 589 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.73 
 
 		 605 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.11 
 
 		 590 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.23 
 
 		 616 aa  748    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 594 aa  1234    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.23 
 
 		 592 aa  844    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.36 
 
 		 598 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  57.82 
 
 		 584 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.78 
 
 		 613 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.89 
 
 		 587 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.73 
 
 		 605 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.13 
 
 		 589 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 592 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.42 
 
 		 603 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  65.48 
 
 		 601 aa  805    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.39 
 
 		 596 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.13 
 
 		 596 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.76 
 
 		 595 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.51 
 
 		 587 aa  807    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.49 
 
 		 594 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.26 
 
 		 591 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  66.16 
 
 		 601 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.31 
 
 		 602 aa  803    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.52 
 
 		 604 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.23 
 
 		 605 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.53 
 
 		 598 aa  660    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  62.94 
 
 		 601 aa  778    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.45 
 
 		 590 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 612 aa  667    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  66.72 
 
 		 598 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.1 
 
 		 591 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.13 
 
 		 588 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.48 
 
 		 590 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.56 
 
 		 616 aa  751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.41 
 
 		 592 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  66.55 
 
 		 596 aa  833    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.57 
 
 		 616 aa  736    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.06 
 
 		 608 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.61 
 
 		 604 aa  661    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.43 
 
 		 591 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.13 
 
 		 590 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  64.65 
 
 		 592 aa  805    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.77 
 
 		 591 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 612 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.31 
 
 		 611 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.94 
 
 		 591 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.17 
 
 		 602 aa  837    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  64.14 
 
 		 592 aa  799    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  64.81 
 
 		 601 aa  793    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.07 
 
 		 592 aa  853    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.56 
 
 		 596 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.91 
 
 		 592 aa  852    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55 
 
 		 595 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.77 
 
 		 591 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.77 
 
 		 590 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 597 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.43 
 
 		 591 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.07 
 
 		 592 aa  853    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  62.01 
 
 		 595 aa  738    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.57 
 
 		 605 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.77 
 
 		 591 aa  808    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.96 
 
 		 588 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 596 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.07 
 
 		 608 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.6 
 
 		 591 aa  811    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29304  predicted protein  55.72 
 
 		 633 aa  639    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.41 
 
 		 603 aa  664    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.96 
 
 		 588 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0953  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.6 
 
 		 614 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 596 aa  661    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  66.67 
 
 		 602 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.06 
 
 		 597 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  65.48 
 
 		 601 aa  805    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  77.39 
 
 		 597 aa  946    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.5 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.62 
 
 		 607 aa  634  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.3 
 
 		 606 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.97 
 
 		 607 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.62 
 
 		 607 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.96 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>