126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2414 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 492 aa  983    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  30.55 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 504 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 497 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 479 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.18 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.15 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.18 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.15 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.46 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.46 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.64 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 510 aa  90.5  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.08 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 575 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.54 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.54 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.54 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.54 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.54 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  21.14 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.14 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  23.66 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.7 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.34 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.51 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.32 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  22.69 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  23.2 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.02 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.02 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  22.05 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.65 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.49 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  25.55 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  24.32 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  20.97 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  34.15 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.4 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  23.03 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 432 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.43 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  20.78 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>