More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1760 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  289  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  38.93 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.96 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40.67 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.75 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38.67 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.42 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.44 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  34.44 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.58 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.87 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.87 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.87 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.44 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  37.42 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  38 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.33 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34.42 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.58 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 156 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.67 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.23 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.3 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.87 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32 
 
 		 200 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.79 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  29.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  29.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.33 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  29.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  29.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  29.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  29.45 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.42 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.42 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.67 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.93 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.55 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  30.67 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.55 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.21 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.76 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.19 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.97 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.11 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 297 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>