More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1077 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  794    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  52.54 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  51.52 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 418 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  38.66 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 419 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  37.69 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 413 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  30.41 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  31.3 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  41.25 
 
 		 217 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  28.98 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  27.02 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.02 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  26.65 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  26.25 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.29 
 
 		 565 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.51 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.51 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.51 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.38 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.07 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  27.12 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.38 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  29.26 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  30.51 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  29.26 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  29.67 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  26.07 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 697 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  29.38 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.83 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  31.35 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.08 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  26.47 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  25.62 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  32.76 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.33 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  24.45 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  28.8 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>