More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2648 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  57.37 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  53.78 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  59.13 
 
 		 253 aa  268  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 253 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  54.84 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  51.79 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  55.78 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  51.79 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  51.79 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  53.82 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  59.46 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  59.23 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  53.41 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  53.41 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  53.41 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  53.41 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  53.41 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  53.01 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  52.19 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  52.19 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  57.54 
 
 		 604 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  57.54 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  56.73 
 
 		 251 aa  258  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  52.19 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  52.19 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  52.19 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  52.19 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  51.79 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  61.23 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  56.12 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  51.39 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  61.21 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  53.62 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  50.6 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  55.41 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  56.18 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  52.99 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  53.85 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  48.61 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  42.15 
 
 		 312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  42.8 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  41.86 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.65 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.5 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  30.81 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.03 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.4 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  27.94 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  27.44 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.12 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  36.88 
 
 		 479 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  34.64 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  29.11 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.12 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  32.03 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  29.2 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  28.76 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  23.72 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.56 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.48 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  30.39 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.25 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  32.21 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  28.39 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.59 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  27.24 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.29 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  26.51 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>