More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0135 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  90 
 
 
256 aa  427  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  89.13 
 
 
230 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 
236 aa  239  3e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
236 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 
230 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  50.88 
 
 
226 aa  235  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 
226 aa  234  1e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 
229 aa  233  2e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  48.66 
 
 
228 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 
230 aa  231  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 
257 aa  231  8e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
239 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
239 aa  230  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.73 
 
 
250 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.73 
 
 
250 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  50.22 
 
 
230 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 
233 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
228 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
234 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
226 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  47.37 
 
 
234 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  50 
 
 
254 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
235 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
226 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.07 
 
 
250 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 
232 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
228 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 
226 aa  221  5e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  47.56 
 
 
227 aa  221  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
226 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48 
 
 
226 aa  221  9e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
229 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 
229 aa  220  1e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
228 aa  220  1e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  48.44 
 
 
225 aa  219  2e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
226 aa  219  2e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
228 aa  219  2e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.44 
 
 
229 aa  220  2e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 
239 aa  219  2e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.22 
 
 
239 aa  219  2e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
226 aa  219  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.7 
 
 
223 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 
237 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 
231 aa  218  4e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 
236 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.4965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
250 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 
232 aa  217  9e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 
230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 
233 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 
245 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 
231 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 
239 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  45.89 
 
 
245 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  49.14 
 
 
250 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.9 
 
 
229 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 
232 aa  216  3e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 
239 aa  216  3e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 
226 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
242 aa  215  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 
227 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 
261 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  46.78 
 
 
242 aa  213  2e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.79 
 
 
229 aa  213  2e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
245 aa  213  2e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 
245 aa  213  2e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  46.02 
 
 
233 aa  212  3e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 
242 aa  212  3e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 
236 aa  213  3e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
242 aa  212  4e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 
234 aa  212  4e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
226 aa  211  6e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 
236 aa  211  6e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  50.22 
 
 
225 aa  211  6e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  45.09 
 
 
233 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
233 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
238 aa  211  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
225 aa  211  8e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
239 aa  211  8e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  47.39 
 
 
236 aa  211  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
232 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  2.82114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 
230 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
225 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
235 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  48 
 
 
228 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 
231 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
239 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 
235 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
234 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 
230 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
228 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.92e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
237 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
235 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.34 
 
 
226 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
229 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
231 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>