More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0864 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  62.59 
 
 		 291 aa  387  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  57.54 
 
 		 287 aa  361  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  46.45 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.06 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  47.14 
 
 		 287 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.82 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  45.45 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  48.29 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  44.44 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  42.76 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  41.07 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.41 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  45.79 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  38.46 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  43.31 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  39.51 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  42.14 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  42.7 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  40.7 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  43.66 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  40.86 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  44.49 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  39.64 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  42.34 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  41.07 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  40.14 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  39.22 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  40.14 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  40.14 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  39.78 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  39.07 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.14 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  40.81 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  38.71 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  39.08 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  38.71 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  42.05 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.57 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  38.57 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  38.71 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  40 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  38.11 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.86 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  37.68 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  38.06 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  46 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  36.62 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  36.59 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  38.06 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  39.27 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  37.28 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  36.27 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  35.92 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  35.92 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.23 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  36.62 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  40 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  37.54 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  40.43 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  38.04 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  44.44 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  37.32 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  34.86 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  36.33 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  36.97 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  36.97 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  36.97 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  38.98 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  40.57 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  38.33 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18345  predicted protein  40.65 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  37.02 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  38.81 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  34.51 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  37.28 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  38.28 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  36.75 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  35.09 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  36.75 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  42.46 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4722  2-methylisocitrate lyase  37.54 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53940  2-methylisocitrate lyase  37.54 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  37.1 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  38.73 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  36.97 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  36.75 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  33.68 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  36.62 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>