More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5121 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
522 aa  1058    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  42.77 
 
 
524 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5116  extracellular solute-binding protein family 5  38.25 
 
 
532 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682235 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.37 
 
 
492 aa  199  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.37 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
493 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
509 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 
508 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.36 
 
 
508 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
492 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
510 aa  180  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.82 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.03 
 
 
524 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.71 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.71 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.71 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.71 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.65 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  33.97 
 
 
523 aa  173  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
522 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
521 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.12 
 
 
513 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  30.52 
 
 
532 aa  171  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
500 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
534 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
512 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
512 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
512 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
501 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.94 
 
 
566 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  32.77 
 
 
513 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
511 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  31.92 
 
 
518 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
519 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
502 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
499 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 
519 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  33.79 
 
 
495 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
515 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.82 
 
 
532 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 
505 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.18 
 
 
509 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
490 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 
513 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
513 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.7 
 
 
535 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.16 
 
 
520 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
553 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 
512 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
555 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
529 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
510 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
520 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.97 
 
 
520 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
489 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
529 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 
508 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  28.51 
 
 
517 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
518 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
534 aa  153  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 
514 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.13 
 
 
537 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
542 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
495 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
535 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 
520 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  30.61 
 
 
506 aa  150  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.44 
 
 
512 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.59 
 
 
512 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
510 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
528 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.18 
 
 
512 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.24 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.18 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.24 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.24 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.18 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.18 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.18 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
520 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.5 
 
 
528 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 
499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>