More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0339 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
542 aa  1062    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  55.43 
 
 
569 aa  581  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  55.81 
 
 
560 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  55.06 
 
 
564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  54.49 
 
 
577 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  54.49 
 
 
577 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  54.31 
 
 
574 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  52.77 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  52.88 
 
 
532 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 
527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  50.97 
 
 
541 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  45.92 
 
 
550 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 
545 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 
544 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  45.54 
 
 
535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  45.96 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  44.87 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  45.96 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  45.96 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 
540 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 
539 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  47.22 
 
 
531 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  45.02 
 
 
530 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  46.61 
 
 
550 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  44.25 
 
 
535 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 
534 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  41.95 
 
 
544 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  43.42 
 
 
544 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  42.56 
 
 
546 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  42.17 
 
 
560 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
562 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
518 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
511 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 
508 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
516 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2076  long-chain-fatty acid CoA ligase  34.55 
 
 
525 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490936  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 
493 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 
499 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 
500 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
509 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
532 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.9 
 
 
543 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
509 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2182  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
525 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.93 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.93 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.37 
 
 
526 aa  213  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
497 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
497 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 
506 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 
506 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 
515 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 
501 aa  210  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  32.33 
 
 
492 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
518 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
523 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
536 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
519 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  31.74 
 
 
487 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
501 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
530 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 
524 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 
516 aa  203  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
517 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 
509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 
522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.6 
 
 
565 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
515 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
515 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 
526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 
516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 
514 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 
525 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
538 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 
527 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 
515 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
516 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 
532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  30.86 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.72 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 
537 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 
507 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.15 
 
 
529 aa  197  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
492 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
511 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 
502 aa  196  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>