More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2076 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5887  AMP-dependent synthetase and ligase  74.56 
 
 		 517 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0385595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2182  AMP-dependent synthetase and ligase  92.57 
 
 		 525 aa  996    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2076  long-chain-fatty acid CoA ligase  100 
 
 		 525 aa  1080    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6670  AMP-dependent synthetase and ligase  82.55 
 
 		 530 aa  886    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2055  AMP-dependent synthetase and ligase  70.89 
 
 		 472 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  73.96 
 
 		 517 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  62.35 
 
 		 517 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  63.97 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0851  AMP-dependent synthetase and ligase  62.02 
 
 		 517 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.422198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  59.41 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4726  AMP-dependent synthetase and ligase  62.72 
 
 		 519 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.670318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  64.12 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  55.06 
 
 		 522 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 		 519 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 		 518 aa  273  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.35 
 
 		 518 aa  273  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 530 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.8 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 538 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.48 
 
 		 518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.77 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.52 
 
 		 503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 509 aa  233  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  31.69 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 1043 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 516 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 520 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 542 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 521 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 515 aa  216  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 518 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.86 
 
 		 516 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  32.84 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.35 
 
 		 529 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.35 
 
 		 481 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.28 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.15 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.95 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 508 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.94 
 
 		 492 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  30.59 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.28 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.28 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.26 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.26 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.26 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 566 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 512 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.17 
 
 		 496 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.19 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 511 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 582 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.23 
 
 		 561 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.26 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>