More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2182 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2182  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 525 aa  1077    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5887  AMP-dependent synthetase and ligase  74.9 
 
 		 517 aa  777    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0385595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6670  AMP-dependent synthetase and ligase  82.74 
 
 		 530 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2055  AMP-dependent synthetase and ligase  75 
 
 		 472 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2076  long-chain-fatty acid CoA ligase  92.57 
 
 		 525 aa  996    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  74.8 
 
 		 517 aa  766    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  61.14 
 
 		 511 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  64.16 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0671  AMP-dependent synthetase and ligase  62.62 
 
 		 517 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  63.97 
 
 		 513 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.169508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0851  AMP-dependent synthetase and ligase  61.43 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.422198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4726  AMP-dependent synthetase and ligase  63.1 
 
 		 519 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.670318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  56.06 
 
 		 522 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 520 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 538 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.9 
 
 		 524 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 519 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.78 
 
 		 518 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 518 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.86 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.48 
 
 		 518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 521 aa  249  9e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.92 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 502 aa  237  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  34.59 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 520 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 509 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 525 aa  230  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.16 
 
 		 503 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.05 
 
 		 516 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 517 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.63 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 525 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 1043 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 518 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.94 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.52 
 
 		 496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 521 aa  213  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  30.75 
 
 		 533 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.26 
 
 		 481 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 542 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  32.95 
 
 		 536 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 527 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  30.29 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.96 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.34 
 
 		 561 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.88 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 525 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.46 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.46 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.46 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  31.35 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>