More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4684 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 291 aa  593  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  39.53 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  33.7 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  39.79 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  31.97 
 
 		 847 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.47 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.93 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 276 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.43 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.94 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  28.72 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  30.53 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.72 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  29.08 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  30.8 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>