More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0940 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 516 aa  1065    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  52.9 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  52.12 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  52.32 
 
 		 520 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  51.45 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  50.58 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  51.76 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  47.3 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  49.71 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  48.81 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  39.41 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  39.27 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  38.92 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  37.73 
 
 		 570 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  38.8 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  36.78 
 
 		 570 aa  344  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  36.9 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  33.27 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  34.88 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  33.98 
 
 		 543 aa  309  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  36.89 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  36.89 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.01 
 
 		 562 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  37.08 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.15 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.99 
 
 		 559 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  38.87 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  32.87 
 
 		 515 aa  291  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  34.69 
 
 		 492 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.83 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  38.44 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  43.07 
 
 		 604 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  36.82 
 
 		 702 aa  287  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  33.8 
 
 		 564 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  35.64 
 
 		 531 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.63 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  35.63 
 
 		 908 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  35.38 
 
 		 537 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  35.14 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  36.76 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  34.56 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  36.88 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  34.36 
 
 		 530 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.56 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  35.84 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  35.4 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  34.7 
 
 		 1007 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  35.8 
 
 		 922 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  35.4 
 
 		 497 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  36.41 
 
 		 488 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  31.05 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  36.18 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  35.71 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  36.41 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  34.18 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  34.97 
 
 		 489 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  35.22 
 
 		 990 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  36.18 
 
 		 502 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  36.18 
 
 		 502 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  35.51 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  35.71 
 
 		 488 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  35.71 
 
 		 488 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  36.22 
 
 		 499 aa  267  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  36.04 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  35.71 
 
 		 502 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  35.25 
 
 		 489 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  35.05 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  35.48 
 
 		 489 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  35.25 
 
 		 489 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  36.28 
 
 		 493 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  35.48 
 
 		 502 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  34.33 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  34.79 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  32.72 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  35.15 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  36.2 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  35.96 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  36.05 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  35.71 
 
 		 1427 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  33.12 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  35.02 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  36.05 
 
 		 645 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  33.26 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  31.98 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>