More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3652 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  66.28 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  63.95 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  62.01 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  58.48 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  59.44 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.33 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  56.67 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  57.53 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 178 aa  197  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  54.75 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  59.3 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  59.3 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  54.59 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  54.7 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  57.54 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 178 aa  192  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 180 aa  190  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  56.35 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  55.23 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55.25 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  52.78 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  53.89 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  52.51 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  55.49 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.67 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  50 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.33 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  54.71 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  51.74 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  52.78 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>