More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0593 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  74.75 
 
 		 297 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  74.66 
 
 		 296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  72.64 
 
 		 296 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  71.62 
 
 		 296 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  67.23 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  67.57 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 294 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  45.56 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  44.78 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  42.23 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  42.57 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  43.58 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 291 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  44.49 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.86 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  42.12 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>