170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0849 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  852    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  67.68 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.79 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  27.42 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.21 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  29.17 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  29.84 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  26.59 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.57 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  26.44 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  30.14 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  27.67 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.98 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  30.52 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  28.07 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  28.07 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  28.07 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.5 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  29.17 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  28.07 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.96 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  27.19 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  29.7 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  29.67 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  26.64 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.96 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.48 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  26.64 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  26.64 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  24.94 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.7 
 
 		 435 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  25.9 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  27.66 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  29.72 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  27.61 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  29.81 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  27.64 
 
 		 468 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.38 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  27.15 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  28.54 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.47 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  27.18 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  26.21 
 
 		 419 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  27.46 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  26.06 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  27.05 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  26.22 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  28.93 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  26.65 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  26.03 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.05 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  25.06 
 
 		 425 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  25.5 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  29.65 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  27.29 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  26.06 
 
 		 444 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  25.76 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  26.28 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  25.52 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  24.84 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  26.28 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  25.96 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  25.45 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  28.16 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.4 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.8 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  26.44 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  24.78 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  24.78 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 426 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  26.73 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  24.6 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  24.57 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  23.99 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  24.65 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  23.99 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  24.4 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  23.99 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  24.71 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  23.99 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.83 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 452 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.19 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  24.37 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  24.22 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  24.87 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  24.38 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  25.06 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  25.91 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  26.18 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  26.68 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  24.69 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  23.7 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>