More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0069 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 345 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  50.46 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  48.05 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  37.54 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  38.05 
 
 		 350 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  40.25 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_002950  PG1155  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase, putative  34.45 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.43 
 
 		 516 aa  116  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.26 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.76 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  24.39 
 
 		 329 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  22.83 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  25.48 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.51 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.48 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  22.67 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  21.78 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 324 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  26.27 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  24.83 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  25.22 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  22.71 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.51 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  22.71 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.35 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.35 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  24.47 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.82 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.92 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.24 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.48 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  22.65 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  22.1 
 
 		 779 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.65 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.35 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  19.88 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.38 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.01 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2012  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  25.24 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.57 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.6 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  22.49 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  21.85 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.86 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  23.16 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  24.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.58 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.5 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.41 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.41 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.41 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.23 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  21.08 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.7 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  20.17 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  19.17 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.09 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.07 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  25.44 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  21.53 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.31 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  21.26 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.81 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.81 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.81 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.45 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.09 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>