More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0263 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  57 
 
 
324 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
331 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
318 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
381 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 
302 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.3 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.81 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.81 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.16 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.21 
 
 
339 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.17 
 
 
360 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.68 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.58 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.49 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.44 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.79 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  28.65 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  27.08 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.72 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.61 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  25.81 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.08 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.4 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.34 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
352 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.39 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.6 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.92 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.64 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.73 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.73 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.25 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.73 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.67 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  29.37 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  26.3 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.73 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.55 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.01 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03000  heptosyltransferase  22.15 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0265488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  29.61 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.14 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.35 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.58 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  39.32 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  29.11 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  24.81 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.31 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.41 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.79 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0755  glycosyl transferase family 9  27.97 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.95 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  24.91 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.33 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.69 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.67 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0138  LPS heptosyltransferase II  40.5 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.34 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.71 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0311  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.5 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.41 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.3 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  29.94 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  21.64 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.11 
 
 
346 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>