More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1688 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
318 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
323 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2148  glycosyl transferase family 9  40.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.445366  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
317 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2195  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
312 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111352  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0755  glycosyl transferase family 9  31.36 
 
 
324 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.29 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  28.86 
 
 
354 aa  85.9  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  30.28 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  21.91 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.76 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.74 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.25 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.85 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.53 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.85 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.06 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.51 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.27 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.43 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.91 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.77 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.9 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.74 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0122  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  30.14 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  30.14 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  41.28 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.84 
 
 
779 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.45 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.27 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0976  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  29.64 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.92 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.69 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.72 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.16 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  29.01 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  23.95 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.93 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2012  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  27.14 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.15 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.5 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  29.31 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.73 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.67 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.03 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.67 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.36 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0311  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.96 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.7 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  28.27 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0138  LPS heptosyltransferase II  26.96 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.12 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2578  glycosyl transferase family 9  25.45 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  22.98 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.44 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.89 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  22.97 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.99 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.45 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  22.97 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  21.48 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.91 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
475 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.1 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>