More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1964 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 354 aa  726    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.05 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27 
 
 		 779 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  29.13 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  31.55 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.98 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.06 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.63 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.33 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.78 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.11 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.54 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.58 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.67 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  28.25 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  28.25 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  25.81 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  26.8 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  28 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.45 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.65 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.87 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  28.15 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.11 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.61 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.61 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.87 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  27.42 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.85 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.85 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  24.23 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.41 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  27.7 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.6 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.07 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.73 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.78 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  26.33 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.05 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.05 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.7 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.23 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.36 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.36 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.77 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.08 
 
 		 329 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  24.41 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.92 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.07 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.35 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.86 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.08 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  21.74 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.16 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.92 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.54 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.96 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  26.26 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.07 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>