More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0353 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
357 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  78.12 
 
 
362 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  61.27 
 
 
341 aa  341  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  59.71 
 
 
343 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  55.13 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  57.8 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  55.27 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  53.08 
 
 
593 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  51.26 
 
 
398 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  54.44 
 
 
593 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  48.68 
 
 
467 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  33.15 
 
 
361 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
401 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
401 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
401 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
400 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
400 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  31.56 
 
 
348 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.58 
 
 
393 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  29.75 
 
 
367 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.37 
 
 
415 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  30.64 
 
 
358 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  32.97 
 
 
403 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  32.97 
 
 
403 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.69 
 
 
343 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
408 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  27.78 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  34.88 
 
 
334 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  28.62 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.65 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  31.36 
 
 
779 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  40.49 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.25 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  45.61 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
625 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
643 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
625 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
628 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  40 
 
 
622 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.72 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  40.74 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  29.72 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  29.72 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.72 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.72 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.72 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.7 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.5 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.66 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.47 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  33.92 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  34.98 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  39.85 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.37 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  21.69 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  43.27 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.42 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  43.27 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  43.27 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  43.27 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  43.27 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  43.27 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  43.27 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  21.14 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.84 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  43.14 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  27.61 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  34.32 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  41.4 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.88 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.26 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.88 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.63 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  38.64 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  34.62 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.35 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  34.62 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  37.89 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  30.77 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>