More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2148 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2148  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
300 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.445366  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  55.34 
 
 
317 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2195  glycosyl transferase family protein  60.51 
 
 
312 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  47.34 
 
 
323 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  40.72 
 
 
318 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0755  glycosyl transferase family 9  34.45 
 
 
324 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0122  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
327 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  29.58 
 
 
350 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.01 
 
 
352 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  28.29 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.39 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.73 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.98 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.45 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.81 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.79 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.8 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  29.79 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.97 
 
 
779 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  37.88 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.59 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.93 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.13 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  49.56 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.72 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  47.62 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  30.58 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.05 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.29 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.81 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  37.5 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.05 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.24 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  45.19 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.1 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  28.52 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  45.37 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  28.52 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  28.43 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  27.89 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.56 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  28.52 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  34.95 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.26 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.38 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  25.85 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.46 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.68 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.72 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.86 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.42 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
356 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.22 
 
 
352 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  28.95 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.16 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.84 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  32.72 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  35.67 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.55 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.55 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  26.07 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.66 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.83 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.7 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
549 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  42.57 
 
 
574 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  29.41 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.13 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.13 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  29.41 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.18 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.41 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.87 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>