More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2637 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  100 
 
 
330 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  59.78 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  54.78 
 
 
334 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  61.2 
 
 
339 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  57.36 
 
 
318 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  55.14 
 
 
358 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  54.4 
 
 
358 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  51.58 
 
 
328 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  51.47 
 
 
324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  52.75 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  66.05 
 
 
410 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  31.58 
 
 
356 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
358 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  33.44 
 
 
340 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
390 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  31.92 
 
 
334 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  31 
 
 
352 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
358 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
358 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.29 
 
 
371 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  34.29 
 
 
371 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.29 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.78 
 
 
371 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
362 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.29 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  34.29 
 
 
371 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  35.09 
 
 
381 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  35.09 
 
 
381 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  29.22 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  50.37 
 
 
343 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.63 
 
 
338 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.4 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  31.94 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  28.62 
 
 
348 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
382 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  30.26 
 
 
347 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  32.21 
 
 
381 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
344 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  29.22 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  32.6 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  26.18 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.11 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  40 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.9 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.39 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.39 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.39 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.23 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  41.75 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  41.75 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  41.75 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  41.75 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  41.75 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  41.75 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  41.75 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  35.19 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.55 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.05 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.02 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.13 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  25.83 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.87 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.71 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.62 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.74 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.74 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.74 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.74 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.74 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  43.36 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.21 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  30.36 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.33 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  34.4 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  29.87 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.46 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  32.92 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  44.83 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.12 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  31.06 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.12 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>