More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2461 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  100 
 
 
410 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  66.05 
 
 
330 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  60.39 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0710  glycosyl transferase family protein  62.34 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0566635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  54.49 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11210  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  61.87 
 
 
358 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.957009  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  57.86 
 
 
317 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  56.43 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  51.83 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  51.72 
 
 
328 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0462  glycosyl transferase family 9  56.96 
 
 
311 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  52.38 
 
 
343 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  45.95 
 
 
340 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  44.19 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 
358 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  30 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  48.25 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  43.79 
 
 
381 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  43.79 
 
 
381 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  40.7 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  38.02 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  35.95 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  44.83 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  45.69 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.25 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.97 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.97 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.97 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  50 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  50 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  50 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  41.6 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  43.69 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  43.69 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  43.69 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  32.12 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  43.1 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.61 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  32.84 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.57 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  50.89 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  35.62 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  50.89 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  50.89 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36.8 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  48.12 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  44.66 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  42.02 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  32.98 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  37.84 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  35.62 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
625 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
643 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  38.98 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
628 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
625 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  42.37 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  41.44 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  41.82 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.4 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  45 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.26 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.59 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.59 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.59 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.59 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.59 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>