More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0375 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 		 362 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  32.14 
 
 		 779 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  34.66 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  33.05 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.97 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.14 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.46 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.6 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  31.36 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.29 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.29 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.12 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.34 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.06 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.43 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.12 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.12 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 354 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  27.27 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  31.45 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.26 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.64 
 
 		 516 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  32.91 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.78 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  25.21 
 
 		 345 aa  126  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.02 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.55 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.84 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.82 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.18 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.28 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.51 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  26.59 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.98 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  26.82 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.21 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.86 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.74 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.9 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.36 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  31.4 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  29.24 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.79 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  26.1 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.88 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.36 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.36 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.33 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.36 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  30.28 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  26.09 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  26.09 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.84 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.17 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.46 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.17 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.45 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.27 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  31.02 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.43 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.24 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.14 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.06 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.61 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.72 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.8 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.52 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.23 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.06 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.62 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.73 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  30.36 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.43 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  27.58 
 
 		 327 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 367 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  29.62 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>