More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3702 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 359 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  81.05 
 
 		 347 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  80.41 
 
 		 359 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  77.97 
 
 		 347 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  79.06 
 
 		 354 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  80.65 
 
 		 342 aa  567  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  77.84 
 
 		 347 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  77.68 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  77.68 
 
 		 347 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  77.91 
 
 		 340 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  77.91 
 
 		 340 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  77.74 
 
 		 340 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  75.65 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  73.18 
 
 		 343 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  71.97 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  70.52 
 
 		 348 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  55.49 
 
 		 348 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  50.87 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  50.87 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  54.28 
 
 		 347 aa  361  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  57.45 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.39 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  46.63 
 
 		 374 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  44.81 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.65 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  41.34 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  37.94 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  39.83 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  39.35 
 
 		 349 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  39.64 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.87 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  36.87 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.8 
 
 		 779 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.15 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.17 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.99 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.52 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.91 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.04 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.38 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.24 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.75 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.45 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.3 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.54 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.54 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.49 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.92 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.17 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.26 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.26 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.2 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.26 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.53 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.53 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.63 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.53 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  27.08 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.01 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  30.03 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  26.77 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  26.69 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.01 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.31 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.02 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.89 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.89 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.39 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.89 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.71 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.46 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.57 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.89 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.22 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.77 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>