More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0589 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
326 aa  659    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  70.46 
 
 
327 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.55 
 
 
339 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
335 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.41 
 
 
324 aa  200  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1399  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.62 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348076  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.86 
 
 
342 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0470  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.78 
 
 
324 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0284268  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.11 
 
 
342 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.82 
 
 
342 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  33.33 
 
 
354 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.84 
 
 
321 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
354 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.77 
 
 
354 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.77 
 
 
355 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.04 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  28.32 
 
 
354 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.94 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.49 
 
 
352 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.49 
 
 
352 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.14 
 
 
352 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.14 
 
 
352 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.08 
 
 
322 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.78 
 
 
327 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.67 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.02 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.72 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.63 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.67 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
326 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  27.97 
 
 
300 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.97 
 
 
319 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
330 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  29.11 
 
 
350 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.37 
 
 
317 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
323 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
323 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
323 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.37 
 
 
317 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.72 
 
 
321 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.72 
 
 
321 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.37 
 
 
317 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.3 
 
 
351 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.72 
 
 
321 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  28.32 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.97 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  27.62 
 
 
323 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.77 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.14 
 
 
324 aa  126  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.42 
 
 
314 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.09 
 
 
347 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.95 
 
 
353 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.06 
 
 
353 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.6 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  26.45 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.9 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.45 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.17 
 
 
346 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  26.33 
 
 
355 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.9 
 
 
327 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.51 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.18 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.37 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.33 
 
 
366 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  28.38 
 
 
779 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.51 
 
 
332 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.82 
 
 
357 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.35 
 
 
314 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  25.86 
 
 
334 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.84 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.98 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.34 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.1 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.34 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.34 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.43 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.56 
 
 
317 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.72 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.9 
 
 
336 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  27.08 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  27.08 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  27.08 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.12 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  27.08 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0634  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  25.18 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415835  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.58 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  23.81 
 
 
332 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.91 
 
 
340 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.18 
 
 
314 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.91 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.91 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.91 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.99 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.34 
 
 
363 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.91 
 
 
374 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.35 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.83 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.58 
 
 
360 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.35 
 
 
332 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.08 
 
 
331 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>