More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3404 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
351 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  64.55 
 
 
355 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  64.74 
 
 
366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  58.96 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  57.8 
 
 
346 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  51.3 
 
 
353 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  44.32 
 
 
350 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  33.14 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.63 
 
 
334 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  35.58 
 
 
323 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
354 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.93 
 
 
352 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
354 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.23 
 
 
355 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.89 
 
 
353 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.21 
 
 
347 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  34.86 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.84 
 
 
352 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.84 
 
 
352 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.98 
 
 
327 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  35.13 
 
 
322 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28 
 
 
339 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.73 
 
 
352 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.77 
 
 
320 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  30.53 
 
 
779 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.78 
 
 
327 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.44 
 
 
319 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.44 
 
 
323 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.44 
 
 
323 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.87 
 
 
326 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.44 
 
 
326 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.11 
 
 
323 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.11 
 
 
323 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0588  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.25 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.55 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.23 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.49 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.17 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.34 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33 
 
 
323 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.44 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.44 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.44 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.31 
 
 
335 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.6 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.84 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.87 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.35 
 
 
314 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.97 
 
 
363 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.65 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.3 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  29.13 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  30.56 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.31 
 
 
332 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.31 
 
 
332 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.93 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.98 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.25 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.98 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.67 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.67 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.62 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.67 
 
 
317 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.95 
 
 
355 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
340 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
340 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
340 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.93 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.3 
 
 
332 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.27 
 
 
331 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
357 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
357 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
331 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.53 
 
 
380 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.41 
 
 
333 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  30 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.07 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  30.42 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.54 
 
 
354 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.58 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.58 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.58 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.35 
 
 
340 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  30.58 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  30.58 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  30.61 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  30.58 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.2 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.2 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.2 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  30.58 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.84 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.71 
 
 
314 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.01 
 
 
332 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.19 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>