More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3028 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
340 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  98.53 
 
 
340 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  98.82 
 
 
340 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
340 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  98.82 
 
 
340 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  98.82 
 
 
340 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
340 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1574  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  94.41 
 
 
340 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.532477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  69.42 
 
 
332 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  69.42 
 
 
332 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  69.42 
 
 
332 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  70.34 
 
 
340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  70.03 
 
 
332 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  69.42 
 
 
332 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2410  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  70.64 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0634  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  68.5 
 
 
332 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415835  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  60.74 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  60.12 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  58.1 
 
 
336 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  50.15 
 
 
340 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.44 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.41 
 
 
321 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.89 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.27 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.18 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.18 
 
 
363 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.93 
 
 
333 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36 
 
 
326 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  36 
 
 
300 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.08 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.59 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.08 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.08 
 
 
357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.97 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  35.67 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.74 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36.21 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  35.67 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.31 
 
 
332 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.2 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  36.2 
 
 
331 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  36.2 
 
 
331 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  36.08 
 
 
330 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.47 
 
 
342 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.78 
 
 
355 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.1 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.89 
 
 
355 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.89 
 
 
355 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.2 
 
 
353 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  34.86 
 
 
333 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.47 
 
 
331 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  35.89 
 
 
355 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.72 
 
 
332 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  35.89 
 
 
355 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  38.81 
 
 
332 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.66 
 
 
317 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.35 
 
 
317 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.36 
 
 
317 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.47 
 
 
357 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.36 
 
 
317 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.47 
 
 
357 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.36 
 
 
317 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.67 
 
 
323 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.36 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.36 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  35.52 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.74 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.36 
 
 
328 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.12 
 
 
334 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.91 
 
 
354 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.07 
 
 
374 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  36.22 
 
 
354 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.54 
 
 
355 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.04 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.75 
 
 
322 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.33 
 
 
360 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.04 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  32.04 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  36.07 
 
 
350 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.93 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.59 
 
 
309 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  35.79 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.64 
 
 
352 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
353 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.76 
 
 
352 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.76 
 
 
352 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.59 
 
 
342 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.99 
 
 
352 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0281  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.86 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.93835  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.62 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.75 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.89 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.2 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.27 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
350 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>