More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0367 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  98.3 
 
 
352 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
352 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  96.02 
 
 
352 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  100 
 
 
352 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  78.75 
 
 
353 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  78.98 
 
 
354 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  77.84 
 
 
354 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  74.22 
 
 
355 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  74.5 
 
 
354 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  68.01 
 
 
354 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  71.7 
 
 
334 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  59.66 
 
 
321 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  59.66 
 
 
321 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  59.66 
 
 
321 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  58.31 
 
 
317 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  58.31 
 
 
317 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  58.31 
 
 
317 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  57.97 
 
 
317 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  58.31 
 
 
317 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.95 
 
 
323 aa  328  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.95 
 
 
323 aa  328  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.95 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.61 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.12 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.95 
 
 
323 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.61 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.27 
 
 
323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.27 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  56.95 
 
 
300 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.27 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.19 
 
 
320 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  57.82 
 
 
323 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  53.58 
 
 
321 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  52.55 
 
 
322 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  56.33 
 
 
327 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  47.73 
 
 
347 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  49.13 
 
 
327 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.5 
 
 
357 aa  258  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.39 
 
 
335 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.73 
 
 
324 aa  242  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  44.83 
 
 
314 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  46.02 
 
 
314 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.33 
 
 
314 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  46.21 
 
 
317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.22 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  40.22 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.92 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.1 
 
 
314 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  42.66 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.4 
 
 
355 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.4 
 
 
355 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.4 
 
 
331 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  38.92 
 
 
331 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  38.92 
 
 
355 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  38.92 
 
 
331 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  38.92 
 
 
355 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.36 
 
 
380 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  38.12 
 
 
333 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.13 
 
 
357 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.8 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.13 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.13 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.8 
 
 
331 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.8 
 
 
357 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.8 
 
 
357 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.88 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  39.01 
 
 
332 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.92 
 
 
332 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.46 
 
 
332 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.73 
 
 
309 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.3 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.14 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.36 
 
 
374 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.92 
 
 
353 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.22 
 
 
363 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.71 
 
 
353 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0281  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.13 
 
 
352 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.93835  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  34.77 
 
 
350 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.86 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.18 
 
 
332 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.23 
 
 
342 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.56 
 
 
340 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.84 
 
 
351 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.15 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.15 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.39 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2410  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.18 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.15 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.9 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.08 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.08 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.08 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  32.88 
 
 
334 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1574  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.85 
 
 
340 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.532477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.2 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.2 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.54 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.2 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.8 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.21 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>