More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0111 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 359 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  80.41 
 
 		 359 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  78.59 
 
 		 342 aa  564  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  74.34 
 
 		 347 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  76.47 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  75.3 
 
 		 340 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  75.3 
 
 		 340 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  75 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  72.3 
 
 		 347 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  73.67 
 
 		 354 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  72.59 
 
 		 347 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  72.89 
 
 		 347 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  72.89 
 
 		 347 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  72.27 
 
 		 348 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  72.73 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  71.18 
 
 		 350 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  52.46 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  51.02 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  51.02 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  54.95 
 
 		 334 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.54 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  45.45 
 
 		 351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  45.7 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.65 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  43.2 
 
 		 336 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  44.18 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  38.39 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  39.41 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  39.18 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  38.41 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  40.42 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.18 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  36.18 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  27.17 
 
 		 779 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.97 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.21 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.09 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.24 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.12 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.41 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.41 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.72 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.23 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.82 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.26 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.7 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.57 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.87 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.87 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.66 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.87 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.87 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.95 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.87 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.13 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.13 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.13 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.65 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.23 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.36 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.22 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.22 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.22 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.22 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.22 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.22 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.16 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.38 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.13 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  24.76 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.29 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  27.1 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  27.95 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.96 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.51 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.92 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>