More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0678 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
365 aa  734    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.48 
 
 
359 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.16 
 
 
352 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
347 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.21 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.47 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.52 
 
 
779 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
339 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.52 
 
 
359 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
379 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.83 
 
 
516 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.03 
 
 
354 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.48 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.97 
 
 
353 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.6 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.52 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  31.84 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.57 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.8 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.8 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  26.49 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.28 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.38 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.38 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.82 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.87 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  40 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.09 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.59 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  26.28 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.7 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  40.23 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.44 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  35.34 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  35.34 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  23.73 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.63 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.38 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.15 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  38.14 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.92 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  38.14 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.3 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.62 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.37 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.72 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.3 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.65 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  26.45 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  24.92 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.65 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.17 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.91 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  26.58 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.77 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  21.86 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.91 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.91 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  36.19 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  24.18 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.37 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>