More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0715 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
344 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  62.68 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  58.43 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  55.29 
 
 
338 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  57.8 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  54.65 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  59.09 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1760  HAD superfamily hydrolase  55.26 
 
 
593 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  51.15 
 
 
398 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1746  HAD superfamily hydrolase  54.57 
 
 
593 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0409111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0897  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  52.63 
 
 
467 aa  236  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  39.48 
 
 
361 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 
405 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
401 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.65 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  34.9 
 
 
348 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 
401 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 
401 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
400 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  37.72 
 
 
393 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.21 
 
 
415 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  35.68 
 
 
403 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  35.68 
 
 
403 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  32.07 
 
 
367 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  33.13 
 
 
358 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  33.15 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  30.48 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.98 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
643 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
622 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
625 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
622 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
628 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
622 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  42.86 
 
 
625 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.9 
 
 
343 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.88 
 
 
299 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  31.9 
 
 
779 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  43.04 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  39.82 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.21 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  18.51 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
382 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.99 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  29.58 
 
 
356 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.5 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.39 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  26.6 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.24 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  31.25 
 
 
388 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.76 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  31.75 
 
 
371 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  31.75 
 
 
371 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  30.98 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.75 
 
 
371 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.81 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  45.26 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  38.61 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  38.61 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.75 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.36 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.45 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.45 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.54 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.86 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  45.95 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  29.49 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  29.49 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  38.95 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  38.39 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  39.02 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.6 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.16 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.23 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.1 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.7 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  27.8 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.52 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.23 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  47.79 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  47.79 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.72 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  47.79 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.26 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>