More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1293 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  99.14 
 
 
350 aa  716    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
350 aa  724    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  75.15 
 
 
340 aa  517  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  72.81 
 
 
348 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  47.93 
 
 
374 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 
362 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  43.49 
 
 
347 aa  285  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  38.17 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  38.17 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.15 
 
 
357 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 
340 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
347 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  39.52 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  40.77 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  39.22 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  40.18 
 
 
347 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
347 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
350 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  34.8 
 
 
351 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
354 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  39.38 
 
 
334 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  40.77 
 
 
347 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  40.77 
 
 
347 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 
347 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
359 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
348 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
359 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
357 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
348 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  37.09 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.66 
 
 
351 aa  238  9e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.33 
 
 
340 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.92 
 
 
779 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.9 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.73 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.41 
 
 
348 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.58 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 
332 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 
332 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.43 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.74 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
316 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.74 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.5 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.17 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.33 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.92 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.57 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.73 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  25.76 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.17 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.63 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.32 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.6 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.82 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.99 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.66 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  24.13 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.59 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.75 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.75 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.58 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  20.48 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.89 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.31 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.49 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.31 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.2 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.1 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  29.24 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.31 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.75 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.31 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  23.73 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.67 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>