More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5002 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.72 
 
 		 352 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 352 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 340 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 352 aa  730    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.15 
 
 		 352 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  99.71 
 
 		 340 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  99.15 
 
 		 352 aa  724    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 340 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  73.33 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.51 
 
 		 356 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.51 
 
 		 356 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.51 
 
 		 356 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  71.51 
 
 		 356 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.89 
 
 		 356 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  50.29 
 
 		 356 aa  338  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  45.93 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  39.71 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  41.57 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  41.57 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  41.28 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  39.14 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36.25 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36.39 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36.75 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  36.39 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.31 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33.11 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  32.23 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.26 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.04 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  29.28 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29.64 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.61 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.27 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  27.98 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.21 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 475 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  27.91 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.76 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  27.2 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.62 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  27.39 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.1 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  27.51 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.96 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.54 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.89 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  26.3 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.65 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  25.5 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  21.04 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.36 
 
 		 516 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.16 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  26.21 
 
 		 350 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  26.94 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  20.46 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  29.77 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  20.64 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1800  LPS heptosyltransferase-like  25.25 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  22.11 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  21.04 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  21.75 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  20.82 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  27.15 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  25.84 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 409 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.67 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  28.66 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  21.11 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.76 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.49 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>