More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0062 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  97.08 
 
 
347 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
354 aa  734    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  97.38 
 
 
347 aa  690    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  94.46 
 
 
347 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  97.38 
 
 
347 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  87.28 
 
 
347 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  87.02 
 
 
340 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  87.32 
 
 
340 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  86.73 
 
 
340 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  79.06 
 
 
359 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  77.88 
 
 
347 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  77.58 
 
 
342 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  73.67 
 
 
359 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  72.86 
 
 
343 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  72.46 
 
 
348 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  71.76 
 
 
350 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  56.73 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  54.52 
 
 
347 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  49.57 
 
 
356 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  49.57 
 
 
373 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  56.06 
 
 
334 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.97 
 
 
357 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  45.13 
 
 
351 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  43.82 
 
 
374 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.81 
 
 
340 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
362 aa  292  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  45.32 
 
 
364 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  41.57 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
350 aa  250  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
336 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  39.29 
 
 
349 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  38.3 
 
 
349 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  40.3 
 
 
350 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
357 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  40.66 
 
 
340 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  37.35 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  37.35 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  29.28 
 
 
779 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.9 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
364 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.56 
 
 
354 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.27 
 
 
359 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.15 
 
 
348 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.78 
 
 
332 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.78 
 
 
332 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.24 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
347 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.08 
 
 
360 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.12 
 
 
332 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.31 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.85 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.85 
 
 
458 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.22 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  26.14 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.22 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.22 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.22 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.22 
 
 
352 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.59 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  22.56 
 
 
340 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.58 
 
 
348 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
359 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.56 
 
 
340 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.56 
 
 
340 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  24.18 
 
 
394 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  27.39 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.59 
 
 
368 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.88 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.88 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.88 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.88 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.88 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.04 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  25.93 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.25 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.89 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.61 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  38.71 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  27.34 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.49 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.92 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.09 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.08 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>