More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3406 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 337 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  52.15 
 
 		 339 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  32.67 
 
 		 779 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.52 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.46 
 
 		 516 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.46 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.99 
 
 		 361 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.78 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.9 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.82 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.84 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.97 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  33.05 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.99 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.48 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.26 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  28.15 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  29.15 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.41 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  31.74 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.65 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.67 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.87 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.25 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  30.21 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  26.84 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.03 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  27.98 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  27.98 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.12 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.38 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  29.39 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.49 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.93 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  27.73 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  28.32 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.62 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  29.06 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  28.66 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  26.67 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.68 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 475 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  27.63 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.27 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.41 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.8 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.7 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 403 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  33.14 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 404 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.02 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  27.62 
 
 		 370 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  28.01 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  28.75 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.57 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.62 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  27.07 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.28 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  28.49 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  27.39 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.62 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  27.87 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>